上海世博会事务协调局（以下简称“上海世博局”）是世博会的组织者，于2003年10月30日成立。在组委会、执委会领导下，上海世博局具体负责世博会的筹备、组织、运作和管理，并协助世博会政府总代表开展工作。上海世博局的主要职责是：承担上海世博会执委会在决策、协调中的日常工作；负责上海世博会筹备工作的日常组织管理、协调与上海世博会有关的对外合作与交流活动及世博会的运营工作。
世博局设置的部门及其主要职责如下：
1、办公室
2、综合计划部
（1）资产管理中心
3、国际参展部
4、参展者服务中心
（1）订房中心
5、技术办公室
6、工程部（工程建设指挥部办公室）
7、总建筑师办公室
8、总工程师办公室
9、礼宾部
10、接待部
11、园区商业管理服务部
12、市场开发部
13、物流中心
14、参观者服务中心
15、票务中心
16、安保部
（1）证件管理中心
17、交通管理部
18、信息化部
（1）信息中心
19、园区志愿者部
20、新闻宣传部
（1）世博网站
（2）世博杂志
21、论坛事务部
22、活动部
23、主题演绎部／研究中心
24、规划部
25、资金财务部
26、人力资源部
27、培训中心
28、法律事务部
29、行政中心
30、党群工作部
31、监察审计部
32、中国馆部
33、主题馆部
34、非洲联合馆管理部
35、AB片区部
36、C片区部
37、DE片区部
38、城市最佳实践区部
39、绿地公园片区域
